Ingenuity Variant Analysis (IVA)2018春季更新

2018-04-10 17:38:13 来源:源资科技市场部

新闻摘要:Ingenuity Variant Analysis (IVA)2018春季更新


改进了数据导出功能
      本次更新,从IVA中导出或者下载数据将采用线下模式。就是说不再在线现场下载数据,而是当需要下载数据时会之后收到带有下载链接的邮件用于下载。这一更新能够改进体验度并且支持断点续传。


1 当点击export时:

 


2 会跳出以下窗口:

 

 


3、收到邮件时表明下载链接已经准备好,可以进行下载。下载连接的有效期为30天,文件以gzip格式保存。需要自行解压。


改进上传VCF操作
      以前,VCF文件上传是如果缺失FORMAT或GT值会显示上传失败,本次更新后提高了提高了VCF文件处理能力,允许缺乏FORMAT或GT值,也能进行下游加工和分析。


在AFC中添加CentoMD数据
      本次更新,在Allele Frequency Community(AFC)中添加了CentoMD数据。CentoMD数据报刊了155000条序列样本,其基因型已经整合到AFC中,给出population genetics的更多的理解。


增加了AFC数据
      Allele Frequency Community(AFC)提供了来自public,private和QIAGEN用户的等位基因总结统计数据。这一统计数据是通过QIAGEN生物信息学平台分析的38000余个全基因组及358000余个外显子数据样本的总结结果。

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