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MedeA
模块功能



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MedeA Environment

MedeA Environment将世界先进的模拟引擎与各种理化性质预测模块、实验数据库、结构创建工具和分析工具整合在一起,为用户提供了非常友好的环境,适用于各种应用场景。


MedeA Environment包含以下模块:

数据库:COD (Crystallography Open Database) & COD-GUI

基础建模工具:晶体、表面、超胞、分子、吸附、缺陷、掺杂、聚合物、纳米结构、层状结构等

作业管理:JobServer/TaskServer(基于网页的作业管理和控制)

分析工具:几何性质、对称性、体积、密度、动画轨迹等




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数据库

理论模拟的起点是材料的结构。MedeA整合了多个晶体数据库,每条数据包含结构和性质数据,来源出处,XRD或中子衍射图谱等信息。


InfoMaticA——数据库管理及搜索模块

COD——晶体数据库

Pearson——无机晶体数据库

NCD——无机/有机晶体数据库

MSI Eureka——相图数据库




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特殊建模工具

MedeA Environment中包含多种基础建模工具应用于各种体系和应用领域。除此之外,MedeA中还能够构建界面、异质结、无定型体系、液体混合物、高分子聚合物等特殊的多尺度模型。


Interface Builder——界面异质结建模工具

Amorphous Materials Builder——无定型材料建模工具

Thermoset Builder——热固性材料建模工具

Docking——孔结构吸附分子建模工具

Mesoscale Builder——介观尺度建模工具




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计算引擎

为了能够预测材料的性质,模型体系的能量和原子间的力是首先需要确定的。MedeA平台提供了不同尺度理论支撑的计算引擎,专用于优化平衡结构、计算体系的总能量和原子受力。不同计算引擎的选择由材料的种类、要预测的性质和模型中原子的个数决定。


VASP——量子力学计算模块

LAMMPS——分子动力学计算模块

Gibbs——蒙特卡洛计算模块

MOPAC——半经验量化计算模块

Gaussian-GUI——量化计算接口模块


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性质预测

MedeA平台中提供了基于一种或多种计算引擎(VASP、MOPAC和LAMMPS)的理化性质预测模块,涵盖化学性质、电子、光学、磁学性质、热力学性质、动力学性质、输运性质等。


Transition State Search(TSS)——反应/扩散过渡态搜索工具

Phonon——声子和热力学性质预测工具

Mechanical Thermal(MT)——力学和热力学性质预测工具

Deformation——变形断裂行为预测工具

Electronics——电子输运性质预测工具

UNCLE——全局最优结构搜索工具

Thermal Conductivity——热导率计算工具

Diffusion——扩散行为预测工具

Viscosity——粘度性质计算工具

Surface Tension——表面张力计算工具

Deposition——沉积刻蚀行为预测工具

Cohesive Energy Density(CED)——内聚能密度性质预测工具

P3C——聚合物性质预测工具

Morphology——晶体形貌预测工具




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力场

MedeA提供适用于各种体系的多种力场,如无机、有机、半导体、金属合金、反应力场等。


Forcefields——MedeA力场库(无机、有机、半导体)

EAM——金属合金力场库

ReaxFF——反应力场

Comb3——反应力场

MLP——机器学习力场库




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高通量和机器学习

MedeA平台中涵盖目前先进的高通量和机器学习相关模块,应用于新材料设计和筛选、分子动力学力场生成、QSPR定量结构-性质研究。


HT-Launchpad——高通量计算工具

HT-Descriptors——高通量描述符计算工具

MLP——机器学习力场库

MLPG——机器学习力场生成工具

FFO——力场优化工具

QT——QSPR Toolbox