I will say that enzyme and glucoside must fit together like lock and key in order to be able to exercise a chemical action on each other

Emil Fischer

MedeA Docking能够自动创建，修改和细化主-客体体系结构，利用著名的Metropolis蒙特卡洛算法，快速估计范德华作用，生成并筛选出稳定的体系构象，从而节省用户时间。使用MedeA Docking获得的主-客体结构可以直接应用于力场和第一性原理计算模拟。此模块能够在MedeA图形界面中或MedeA的Flowchart中交互调用。

Alcohol molecules docked in a microporous material using MedeA Docking

功能特点：

• 自动组合主体和客体结构并进行筛选和模拟

• 最小化主客体之间的空间重叠

• 根据能量自动细化吸附物的位置与方向

• 在建模过程中，用户可通过图形界面实现交互式更新，并控制模型的视图和比例

• 能够控制模拟时长，蒙特卡洛温度，最大位置和旋转位移

• 能够组合多种吸附物与主体结构

• 采用Metropolis蒙特卡洛算法，具有可控的搜索标准（在温度设置内控制接受概率）

• 可用于表面、微多孔和多孔材料模型

所需模块：

• MedeA Environment

推荐模块：

• MedeA LAMMPS

• MedeA VASP

• MedeA MOPAC

• MedeA Gibbs

• MedeA Gaussian GUI