MedeA LAMMPS — 基于力场的分子动力学工具
 

A Powerful Gateway to a Powerful Simulation Program

Setting up LAMMPS calculations on complex models using the flowchart interface is a significant productivity enhancer, and accumulating results in tables with the option to add occasional custom commands is very powerful indeed

LAMMPS 是先进的基于力场的分子动力学程序之一，由Dr. Steve Plimpton和他的团队在 Sandia国家实验室开发，能够采用大规模并行和支持GPU的计算机架构实现高效的基于力场的分子动力学计算模拟。

MedeA LAMMPS提供了LAMMPS 程序的图形界面，相比传统的LAMMPS程序，可以简化建模过程，节省时间，并自动生成模拟所需的命令，无需详细学习输入文件的语法，同时也会自动识别力场并分配相应的参数，模拟完成后也可以快速分析结果和误差。 

 能够计算的性质：
 • 计算以下性质的块均值和波动范围：
    – 温度、压强、密度、晶格参数
    – 体系总能量及其组成成分（包含势能、动能、静电作用和分子间作用）
    – 应力张量等
 • 结构优化及分子动力学轨迹可视化
 
 功能特点：
 • 将分子、流体或固体的详细信息自动转换为LAMMPS指定格式的坐标、键连状态、力场参数和命令行
 • 能够实现LAMMPS的核心计算功能：
    – 能量最小化
    – NVE、NVT 和 NPT 系综下的分子动力学模拟
    – 能量和能量的导数（力）的计算等
 • 完全集成MedeA Forcefield，具备先进的力场处理和分配方法
 • 兼容任何符合MedeA力场格式的自定义力场
 • 采用MedeA的流程图功能轻松设置复杂的LAMMPS计算，流程图可以重复使用、编辑、与同事共享或重复运行，即使在不同的系统和服务器上也同样适用
 • 为专业的 LAMMPS用户提供添加自定义指令的选项
 • 结合MedeA JobServer和TaskServer，有序安排MedeA LAMMPS作业流程
 • 通过MedeA JobServer浏览器页面，能够方便快速地验证所有中间和最终的计算结果