2022年IPA春季更新

2022年IPA的靠前最新版本与大家见面啦！此版本改进了易用性并增强了搜索功能，而且，IPA知识库数据量已超过980万条，数据集收录超过11万个。

功能更新

在新版IPA中，搜索工具更易于使用了。所有搜索选项都已整合到主工具栏中，包括Genes and Chemicals，Diseases and Functions，Pathways and Lists，Datasets and Analyses共四大类搜索方式，如下图。
 

此外，用户还可以在标准通路和毒物列表中找到感兴趣的基因、化学物质、疾病和生物功能等，以此加速研究。也可以按名称或其中的基因或化学物质等搜索自己的自定义通路和列表，也可以在添加到通路的注释中搜索。
例如，您可以搜索一个基因名，比如“FASLG”，并找到该基因参与的所有通路和列表（下图）。结果返回了57个经典通路和Tox列表，FASLG在其中是参与者。在以前的IPA版本中，这种查询不会返回结果，因为以前的搜索工具只搜索通路名称和类别，而不搜索通路或列表中包含的基因、化合物等。
 

同样，对功能性疾病术语的搜索，如果该术语位于通路上的节点或通路名称中，搜索结果可返回经典通路或Tox列表（如下图）。
 

对于经典通路，搜索会自动“扩展”到组和复合物，以便在其中查找基因和蛋白质名称。例如，搜索RAF、ARAF、BRAF或RAF1会返回一个包含组“RAF”的经典通路。但是，请注意，当您打开通路时，不会立即看到ARAF、BRAF或RAF1节点，因为它们是RAF组的成员，所以会在图中显示为单个节点。您可以使用“My Pathways”工具栏的“Graph Options”按钮中的“Expand Members/Membership”选项，或右键单击这个组的节点打开“Expand Members/Membership”选项，手动扩展RAF节点来查看这些具体的分子。