MedeA QT——交互式QSPR工具箱
An Interactive QSPR Toolbox
Hansch foresaw the power of large, searchable databases and put “inductive knowledge transfer” into practice
Cherkasov et al., in ‘QSAR Modeling: Where have you been? Where are you going to?’
MedeA QT(“QSPR工具箱”)是一个交互式的工具箱,可用于开发定量结构-性质/活性关系(QSPR/QSAR)模型。MedeA QT利用MedeA的structure list收集分子信息,从而创建模型。MedeA QT可以使用性质或活性的期望值来创建QSPR模型,由此产生的模型不仅可以预测新体系的性质,而且可以研究其物理性质与分子或结构描述符之间的关系,还可以预测不属于训练集的体系的性质。MedeA QT支持交互式评估QSPR模型的质量,并对模型中包含的描述符进行调整。
MedeA QT在MedeA Environment中除了以交互方式使用之外,还可以与MedeA Flowchart一起使用以便于将基于模型的计算结果填入到structure list进行必要的注释。
MedeA QT使QSPR模型的构建更加高效,其无需执行特殊的手动数据转换和处理,可以深入研究物理现象的起源,并将观测的现象与原子描述符之间建立联系。即使对于难以直接模拟的特性,MedeA QT都可以深入研究这些不同特性产生的根本原因。
Developing a transferable model for the heat of vaporization using a training set containing 3,270 organic molecules and a correlative model based on PLS
功能特点:
• 可利用最优描述符集,更容易进行模型比较,从而高效构建QSPR模型
• 免去了手动数据转换和处理的特殊方法
• 使用基于分子和结构的描述符从而广泛的预测物理性质,展示QSPR模型,
• MedeA中任何描述符或性质都可用作QSPR建模
• 交互使用一般最小二乘法(OLS)和偏最小二乘法(PLS)方法开发相关模型
• 基于偏最小二乘(PLS)回归法,计算最优模型
• MedeA QT QSPR模型基于XML的格式存储,是开放、可查看的,方便了检查和发布
• MedeA QT QSPR模型可采用MedeA结构列表,也能应用于MedeA流程图中大规模建模
Investigating the molecular determinants of the glass transition temperature (Tg) of thermoset epoxy systems
所需模块:
• MedeA Environment
推荐模块:
• MedeA P3C
• MedeA MOPAC
• MedeA GAUSSIAN
• MedeA HT-Launchpad