1.研究背景

NF-κB（Nuclear Factor Kappa B）是具有转录激活功能的蛋白质，广泛存在于多种类型的细胞中，在炎症部位会高度表达。并且在免疫反应和炎症反应中起着十分关键的作用。IKK被称为NF-κB激酶亚基抑制剂，参与细胞因子活化的细胞信号通路。IKK家族的成员包含IKK-1和IKK-2，其中IKK-2在各种慢性炎症疾病中发挥重要作用。本研究旨在发现一些抑制IKK-2蛋白的化合物，并用于炎症疾病的治疗。

2.研究流程

图1 筛选流程

研究使用一系列筛选方法从天然产物数据库中筛选有潜在抗炎活性的化合物。首先进行ADME/T预测，排除成药性较差的化合物，然后进行分子对接筛选、对接药效团筛选，最后进行形状相似性（ROCS）和静电相似性（EON）筛选。

3.研究结果

研究首先对筛选的模型进行了筛选效率的评价，然后使用最优模型进行筛选研究。最后选择符合筛选条件（ET_pb≥0.3, ET_shape≥0.5和ET_coulb≥0.3）的274个化合物进行分析。进一步分析发现命中化合物，有17个化合物结构是已经报道具有抗炎活性。这17个化合物主要是多酚类，已有其作为抗氧化剂、预防心血管疾病等方面的报道。筛选命中的另外12个结构新颖的化合物，与已知抑制剂叠合进行聚类分析。结果发现这12个化合物与已知抑制剂的结构差异较大，但是可能会表现出相同的抗炎活性。

4.结论

本研究使用一系列筛选方法从天然产物数据库中命中274个可能有抗炎活性的化合物。研究使用形状相似性和静电相似性筛选方法成功发现了结构新颖的可能表现出抗炎活性的化合物结构，其中有17个化合物是已知的具有抗炎活性的天然提取物，12个化合物是未报道的新颖结构。研究采用的新型抗炎化合物的筛选方法为新型药物的发现提供了指导。

使用模块：

• ROCS

• EON

参考文献：

1. Sala E, Guasch L, Iwaszkiewicz J, et al. Identification of human IKK-2 inhibitors of natural origin (Part II): In Silico prediction of IKK-2 inhibitors in natural extracts with known anti-inflammatory activity[J]. european journal of medicinal chemistry, 2011, 46(12):6098-6103.