公共数据库是获得原始数据的重要来源，常见的数据库有SRA、TCGA、GEO等等。使用公共数据库的优点是成本低、耗时短，可以获得难以采集的样本数据。不过，这些数据往往缺乏统一性、元数据杂乱，因此，想要获取到高质量、高一致性的数据，必须经过数据清洗过程，这就是OmicSoft团队几十年如一日的工作。

随着信息技术的发展，对于从事药物研发或生物标志物发现的人来说，人工智能（AI）在收集多组学数据方面发挥着至关重要的作用。然而，多组学数据和生物关系数据是复杂而微妙的，人工智能得到的数据不足以提供真实准确的生物学背景来对数据进行诠释。因此，将人工智能和人工审核相结合，是一种获得稳健可靠数据的方式，这也正是OmicSoft所秉承并践行的。

在上篇中，我们介绍了OmicSoft在实体瘤中的两项研究案例（点击阅读），接下来是两个得到药企支持的案例。

案例一：STEAP2靶向CAR-T细胞疗法AZD0754在前列腺癌中的抗肿瘤活性

前列腺癌通常被认为是一种免疫“冷”肿瘤类型，对免疫疗法不敏感。因此急需探究针对这种疾病的有效治疗靶点。STEAP2是一种前列腺癌症抗原，在所有疾病阶段都表现出高细胞表面表达，这使其成为治疗靶向的理想选择。要探究靶向STEAP2的基本原理，首先便需要了解靶点的表达谱和定位。研究人员在Omicsoft OncoLand数据库中进行了大规模基因组学筛查，证实了STEAP2在前列腺癌症中过度表达，其中前列腺腺癌和正常前列腺组织显示出比所有其他肿瘤类型和正常组织显著更高的基因表达水平（下图）。总之，这项研究强调了STEAP2在前列腺癌症中的可治疗性，树立了对潜在CAR-T疗法AZD0754的特异性、效力和耐受性的信心。

图注：OncoLand库用于评估人体正常组织和肿瘤中的STEAP2表达

注：这项研究的所有作者均来自阿斯利康。

案例二：肿瘤与正常组织中CCR8的差异表达有利于GS-1811特异性耗竭肿瘤浸润性T调节细胞

肿瘤微环境中Treg细胞与不良预后以及对旨在重新激活抗肿瘤免疫反应的疗法的耐药性有关。因此，清除肿瘤浸润性Treg细胞是克服免疫疗法耐药性的一种潜在方法。GS-1811是一种新的治疗性单克隆抗体，它可以特异性结合人CCR8，经过设计后可以选择性地清除肿瘤浸润性Treg细胞。根据OncoLand中查询到的TCGA数据，在许多适应症中发现原发性肿瘤中CCR8基因表达高于正常邻近组织（下图）。总之，这项研究的数据支持GS-1811在癌症中靶向CCR8并驱动肿瘤Treg耗竭以促进抗肿瘤免疫的临床开发。

图注：原发性肿瘤样本（红条）和邻近正常组织（灰条）的bulk RNA-seq基因表达分析（TCGA）

注：Jounce Therapeutics公司和Gilead Sciences公司对这项研究做出了贡献。

好的数据分析集成平台在科研中是十分关键的，OmicSoft具备持续更新的数据资源和方便灵活的操作界面，已经得到了海内外诸多顶尖药企的青睐。在生物标志物发现、靶点挖掘方面，它可以为用户节省大量的时间和精力。希望源资科技的解决方案可以为大家的研究提供有力的支持。OmicSoft在肿瘤领域的更多应用欢迎参考《使用OmicSoft OncoLand进行药物靶点和生物标志物研究》（点击阅读）。

参考文献

1. Zanvit, Peter et al. “Antitumor activity of AZD0754, a dnTGFβRII-armored, STEAP2-targeted CAR-T cell therapy, in prostate cancer.” The Journal of clinical investigation vol. 133,22 e169655. 15 Nov. 2023, doi:10.1172/JCI169655

2. Weaver, Jessica D et al. “Differential expression of CCR8 in tumors versus normal tissue allows specific depletion of tumor-infiltrating T regulatory cells by GS-1811, a novel Fc-optimized anti-CCR8 antibody.” Oncoimmunology vol. 11,1 2141007. 4 Nov. 2022, doi:10.1080/2162402X.2022.2141007