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09/20
September 20, 2022

【线上讲座】关键调控通路和网络背景下的体细胞变异研究

了探索疾病发生的原理以及挖掘治疗的新靶点,生物信息学无疑是一个高效的工具。

为了探索疾病发生的原理以及挖掘治疗的新靶点,生物信息学无疑是一个高效的工具。但从寻找出新的靶点,一直到这些发现转化为临床应用,还有非常多的路要走。那么有没有一种工具,可以先从试验获得的潜在候选基因或蛋白中筛选出有调控作用的因子,之后再鉴定出这些因子和疾病的关系、这些因子和药物的关系、这些因子在其他实验数据中的表现是否同样关键、这些因子有没有其他研究人员做过验证试验……


IPA不仅可以对信号通路和作用网络进行追踪和深入剖析,还可以鉴定出关键的调控因子。随后,要深入了解与调控基因相关的关键体细胞突变,并研究靶标和疾病的基因组特征,研究人员就可以借助HSMD数据库,这样可以更好地理解临床相关性。HSMD包含实体肿瘤和血液恶性肿瘤中的突变数据,包括基因水平、改变水平和疾病水平的信息,以及临床观察到的跨癌症类型的基因和变异频率等。


在本次讲座中,我们将介绍使用CLC从下机数据中快速鉴定出突变,通过IPA从组学数据中识别关键调控因子,利用HSMD深入了解目标基因和相关疾病的突变。


讲座时间:9月20日(星期二)上午10:00-11:00

讲座题目:关键调控通路和网络背景下的体细胞变异研究

讲者:李娅  技术支持工程师  源资信息科技(上海)有限公司

讲座方式:线上讲座(免费)

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李娅


源资科技技术支持工程师,英国布里斯托大学生物医学硕士,中国药科大学中药学学士。曾任某上市公司英国区NGS全产品技术支持,曾任某头部单细胞公司Data Curator。有单细胞知识库整理、软件测试、客户支持、项目管理等工作经验。