2023年2月28日,“【AI/CADD产品系列】第一讲:Discovery Studio—抗体药物设计与优化”线上讲座顺利举办。本次讲座从抗体序列出发介绍了Discovery Studio在抗体药物设计与优化中的应用。
讲座主要内容
1.抗体序列注释与性质预测:CDR区的识别、Germline gene序列识别、翻译后修饰位点预测和抗原线性表位预测
2.抗体结构预测:抗体3D结构预测、评价与优化
3.抗体功能优化:抗体人源化、抗体-抗原相互作用预测和抗体亲和力成熟
4.抗体成药性预测与优化:抗体聚集效应预测与优化、可开发性打分(DI值)、溶解度和粘度预测与评估
Q&A
1、CDR注释用什么好?imgt,kabat...
DS是支持imgt和kabat等方式来注释CDR区的,从目前了解到信息,比较认可是使用kabat来注释CDR区。
2、GI值的计算公式是?CDR需要算入吗?
GI值指的是在研抗体序列与germline gene所对应的抗体序列一致性的最高值,可通过DS中的抗体序列注释和序列比对直接得到,不需要特殊的计算公式。GI值的计算是包括CDR区的。
3、目前用CADD 进行affinity maturation有成功进入临床和上市的药物吗?能否举例说明?
目前国内有多家抗体研发的公司在使用DS做抗体药物研发,affinity maturation也是十分重要的功能,但是具体的研发案例目前没法披露。
4、说到蛋白结构预测,可能首先想到的是AF2,那还有必要使用DS中的同源模建进行抗体3D结构预测吗?
AF2在预测蛋白结构中的应用确实是值得肯定的,但是在抗体领域,由于抗体本身的保守性较高,所以基于同源模建构建的抗体结构并不是AF2预测出的结果准确性差。
5、怎么看待AI抗体 ?
AI这个概念近几年非常火热,但是对于AI计算在抗体领域中的功能报道并不是特别的多,而且对于AI输出的结果,可解释性不强,与传统的CADD技术相比,其实际价值还有待验证。
6、请问如果购买DS软件,你们可以提供哪些相关服务?
源资科技会为购买DS软件的客户提供为期三天的免费软件培训以及培训后长期的在线答疑,及时的解决用户问题,确保用户能够使用正确熟练的使用DS软件。
7、DS可以构建双抗嘛,特别是非对称性双抗,例如scfv接个linker在全长抗体的轻链或者重链上。
DS可以用于单抗、双抗、VHH、scFV和抗体融合蛋白等3D结构构建。通过linker的方式将构建好的全长抗体和scFV连接也是可以的。
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