Phoenix是美国CERTARA公司的软件产品,主要应用于药动学、药效学和毒代动力学研究,其房室模型分析和非房室模型分析已成为新一代的分析标准,在国内外药物研发单位应用广泛。截至2018年10月,美国FDA为其多个研究部门配备了近400个Phoenix使用许可,全球50强的制药企业均为Phoenix用户,国内用户已超过200个。目前,在美国FDA批准的新药有90-95%在研发过程中使用Phoenix,在Pubmed上采用WinNonlin进行分析的文章已超过4000篇。
近日,Certara公司发布了Phoenix 8.4版本。该版本新增了一系列功能,并修复了若干先前存在的问题,主要集中在易用性、审查日志和兼容性等方面。
随着Phoenix 8.4新版本的发布,对Phoneix 8.1的支持停止,同时Windows 8.1系统不再支持Phoenix软件。接下来让我们共同看下Phoenix 8.4版本更新了哪些内容。
Phoenix整体框架更新
1、新增“使用本地时间”
打开Phoenix软件,点击菜单Edit / Preference / General / Projects,勾选“Use Local Time ”,点击“Apply”,将软件显示时间从之前的UTC(世界时间)切换为本地时间。
2、支持输入 .sas7bdat文件格式。
3、支持输出V5、V6、V8、V9的SAS.xpt格式文件。
4、新增Duplicate(复制)功能:
对操作对象右键单击“Duplicate”,相当于在当前工作流复制+粘贴(Copy+Paste)该操作对象。
Phoenix NLME功能更新
1、在不强制完成所有迭代的情况下提前终止NLME进程
NLME运行时会弹出NLME Job Status,右击运行当前进程可以选择“Cancel(取消)”或“Stop Early(提前终止)”。点击“Cancel”会停止运行且不会输出任何结果(类似“Stop Execution”),点击“Stop Early”会终止迭代并输出没有计算标准误的结果。
点击“Stop Early”输出结果的截图展示(Theta列表未输出Stderr结果):
2、在Predictive Check(预测检验)和Simulation(模拟)功能下新增 “No 0-iter fit?” 选项,勾选后允许跳过初值拟合过程,在复杂模型中可以节约运行时间。
3、Structures(结构)选项卡对应的Absorption下拉菜单新增了“Gamma、Inverse Gaussian、 Weibull”三种延迟吸收的选项,同时原有的“Extravascular”变为“First order”。
4、PML 语言中的 LL 语句现在包含“Type(类型)”参数,用于“Predictive Check(预测检验)”中指定观测变量的类型。可用的选项有 cont、cat、count 和 eventpredout。
5、Predictive Check运行模式下输出的PredCheckAll工作表:现在会输出每一次重复的模拟值(DV列)、群体预测值(PRED列,需勾选“Output PRED”或使用“Pred.Corr”)和校正因子(Cor_Factor列)、校正后模拟值(DV_Cor列,需使用“Pred.Corr”),软件会应用经校正的模拟值绘制VPC图。
6、NLME目前针对输入数据可支持5个ID列,因此在建模和模拟中可以额外多添加5个table来获得相应的结果。
7、Omega列表的输出结果中,所有Occasional变异的标准误均被列出。
8、新增IWRES vs IVAR拟合优度图。
Phoenix的Plot、Table及Reporter功能更新
1、Box Plot(箱型图)操作对象
对于 “Show All Data Points”选项,勾选后得到的图形已经优化(可以看到Y值并不在一条垂线上,避免重叠)。
2、Plot操作对象
新增“Autofit”选项允许用户自定义LOESS回归的平滑曲线:勾选“Autofit”让程序根据图中数据点的数量自动选择平滑参数的值,不勾选“Autofit”则手动输入平滑参数的值。值越大线条越平滑。
3、Table(表格)操作对象
“Statistics(统计)”选项卡允许按组或单个来输出统计量的结果。
4、Table(表格)操作对象
在“Precision Method(准确度方法)”新增“Disabled(禁用)”选项:勾选“Disabled”会保留文本列的前导0(即整数前的0值)。
5、Reporter(报告)操作对象
新增用于选择内容列表中的所有表格或所有图表的选项。
除此之外,此次更新还修复了若干bug,优化了一系列运算结果和会导致报错的情况,为用户使用Phoenix软件提供了更为便捷、高效的体验。
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