MedeA 3.8版本现已发布,更新内容一览:
1. 建模工具
新增微结构建模工具(Microstructure Builder),基于种子生长算法构建微结构模型,可以指定或随机选择超胞中的坐标作为起点,作为晶粒生长的起始位点。从起点出发向外生长,直到原子达到晶界。构建完成的结构可以使用MedeA中其他模块进行结构优化、能量计算和动力学模拟
Supercell Builder中添加了自动构建为正交结构的功能
流程图中的Amorphous Builder阶段现在可以将密度设置为变量
改善了成键计算、导出结构、原子颜色显示等细节
2. 计算引擎
1-VASP
更新至VASP 6.4.2版本
在图形界面中增加和改善了若干分子动力学相关功能:增加nPH系综,优化热浴、约束、动力学过程监测等功能
优化机器学习力场相关功能:加载速度更快,增加了力场的二次拟合功能,为该功能设置了新的用户图形界面
2-LAMMPS
更新自动后处理的作图功能
现在可以导入符合格式的本地LAMMPS轨迹
如果在NPT模拟期间冻结原子将会警告
优化了PCFF+力场缩醛中C的精细非键参数
3-GIBBS
更新至GIBBS 9.7.8版本
3. 其他模块
Polymer Expert(新增)模块:基于PEARL(Polymer Expert Analog Repeat unit Library)数据库进行聚合物的从头设计根据性能和性能范围查询PEARL数据库来识别新型聚合物。您也可以在PEARL数据库中搜索生物衍生的类似物
MLPG模块:允许手动分配结构至训练集或验证集中,导入时可同时添加坐标
P3C模块:现在可以预测更大体系聚合物的性能,结果展示方式更直观
Deposition模块:优化沉积过程中子集设置相关功能
MT模块:更快地加载机器学习力场,优化输出显示
4. 其他功能优化
优化径向分布函数面板显示
新增MedeA Python环境
Linux版本的IntelMPI更新至2019版本
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