一、体验日简介
源资科技一直致力于为生命科学领域的实践者提供高效的解决方案。IPA(Ingenuity Pathway Analysis)是一款组学数据深度分析软件,它基于专家收集和管理的知识库,将文献中已证实的发现生成交互式网络。其图形化界面可方便快速地实现代谢组、蛋白组、转录组等数据的深度分析,助力挖掘实验数据中隐藏的生物学意义。
本次体验日我们将分享疾病分子机理和药物靶点挖掘的相关实例,让大家对IPA的应用有更加具象的认识。而且,源资科技将提供IPA软件试用账号和全天用户培训,并提供强大的技术支持团队,带领大家走近IPA,让生物信息学不再停留在多组学数据分析、生物学通路富集、药物作用的信号通路分析、药靶挖掘、网络药理学这些名词上,而是会通过文献,通过案例进行生动的讲解,让研究人员真正主宰生物信息学这个工具,能够利用多组学数据,利用大数据充分挖掘领域内现有的新研究成果,深入剖析组学数据背后的生物学意义,达到事半功倍的效果。
二、讲者简介
李娅
源资科技技术支持工程师,英国布里斯托大学硕士,中国药科大学学士。曾任某上市公司英国区NGS全产品技术支持,曾任某头部单细胞公司软件与数据部Data Curator。曾负责单细胞知识库整理、软件测试、项目管理等。
三、时间及地点
时间:2023年9月20日 星期三(全天)
地点:线上
四、报名方式
扫码关注“源资科技”,回复“IPA体验”后填写表单报名。注意:若希望获取亲自上机操作的机会,原厂需要单位邮箱来申请试用license,请提供真实可用的含人名的单位邮箱。
五、培训安排
授课内容以实际为准。
讲座:2023年9月20日(星期三)上午10:00-11:00
上机:2023年9月20日(星期三)下午13:30-16:30
时间 | 内容 |
10:00-11:00 | IPA助力疾病分子机理和药物靶点挖掘 |
11:30-13:30 | 午餐&午休 |
13:30-14:15 | Core Analysis 1. 富集通路 2. 预测上游调控子 3. 上下游协同分析 4. 分子互作网络构建与分析 5. 多组学文献案例解析 上机:完成Core Analysis,从分析结果中找出关键通路、关键调控子、构建网络 |
14:15-15:00 | Comparison Analysis和Overlay 1. 对比分析步骤 2. 结果解读及文献案例 上机:完成对比分析,从结果中寻找关键信息 |
15:00-15:10 | 休息 |
15:10-15:50 | Analysis Match和Explorer 1. 组学数据库内容介绍 2. 在数据库中搜索目标基因,依据元数据进行筛 3. 文献案例解读 上机:从公共数据库中综合关键发现 |
15:50-16:30 | 多平台联用 1. IPA与CLC联用 2. IPA与HSMD联用 3. IPA与OmicSoft联用 |
CLC:高通量数据分析平台
CLC包含丰富的生物信息学分析工具,能够整合常规或定制的工作流程并实现自动化,支持三大操作系统,支持基因组学、转录组学、表观遗传学、宏基因组学、单细胞组学等的分析。广泛应用于高校、科研院所、企业。
HSMD:体细胞突变数据库
HSMD是一个体细胞突变数据库,旨在帮助用户更好地理解和定义准确的功能和可操作性,深入了解临床观察到的体细胞变异。用户可进行灵活的查询和筛选,从药物标签、临床试验和专业指南中快速汇总关键发现。
OmicSoft:多组学数据分析平台
OmicSoft组学数据深度挖掘管理平台可实现数据内容管理、数据流程化分析、可视化分析等。用户除了可以导入自己的数据进行分析外,还可以分析OmicSoft内包含的经专家整理的多种组学数据,包括元数据信息十分丰富的数据库OncoLand、Single Cell Land等。