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OpenEye应用案例十二:靶向磷酸二酯酶1的潜在抗癌药物--螺羟吲哚衍生物
本研究期望通过对螺羟吲哚的结构修饰,来发现高效的磷酸二酯酶1抑制剂,用于癌症的治疗。
OpenEye应用案例十一:发现抑制血栓形成的新型乙酰胆碱酯酶抑制剂
本次案例分享就给大家介绍一个发现新型阿尔兹海默症药物的途径。研究主要是使用计算机辅助药物设计方法-虚拟筛选,发现了一个潜在的高效抑制剂,有望为阿尔兹海默症的治疗提供有效的指导。
OpenEye应用案例十:基于虚拟筛选方法发现马来丝虫(Brugia malayi) 谷胱甘肽-S-转移酶抑制剂
丝虫病的临床表现轻重不一,在流行地区可有50%~75%的“无症状”的感染者。马来丝虫主要寄生在浅部淋巴系统,引发严重的四肢淋巴管炎和象皮肿。谷胱甘肽-S-转移酶(GST)是治疗由马来丝虫感染所导致的淋巴丝虫病的重要靶标。该酶发挥的主要作用是解毒,以及转运一些重要的亲脂性化合物。GST在保护组织以抵御氧化侵害及氧化压力中也有重要作用。 GST是一个二聚体多功能酶,是由两个208个残基的单体组成,分子量为45~50 kDa。
OpenEye应用案例九:虚拟筛选发现新型GPER1抑制剂
研究使用基于配体和基于受体的方法进行虚拟筛选发现新型G蛋白偶联雌激素膜受体抑制剂。
OpenEye应用案例八:抗炎药和抗高血压药作为细菌二鸟苷酸环化酶抑制剂
本研究基于虚拟筛选的方法筛选DrugBank数据库中FDA批准的药物,发现潜在的c-di-GMP抑制剂,用于治疗病菌感染引起的慢性疾病。
OpenEye应用案例七:虚拟筛选方法发现吡咯烷酮类化合物具有潜在的杀虫活性
怎样才能快速的发现杀虫剂,控制蚊子的生长速度?带着这个疑问,我们将给大家介绍一个快速发现新型杀虫活性化合物的方法。
OpenEye应用案例六:基于形状和静电相似性的方法发现高效的CYP1B1抑制剂
CYP1B1是细胞色素P450超家族的一个亚型,参与多环芳香烃等前致癌物的代谢活化,并在17-β-雌二醇诱导的乳腺癌发生与发展过程中起到了关键性作用。
OpenEye应用案例五:基于相似性筛选、对接筛选和分子动力学模拟研究发现新型hAChE抑制剂
本研究结合静电相似性筛选、对接筛选和分子动力学模拟发现了7个新型的潜在的阿尔茨海默病治疗药。
OpenEye应用案例四:基于蛋白和配体相互识别的物理化学性质发现CDK9抑制剂
在本研究中,我们选择靶标蛋白CDK9,使用计算机辅助虚拟筛选的方法发现潜在抑制剂。研究使用形状相似性筛选和静电相似性筛选,以及分子对接、活性位点分析、ADME预测的方法从ZINC数据库中发现潜在的先导化合物ZINC91953032。计算结果表明化合物ZINC91953032可以作为抗肿瘤抑制剂进行后期临床研究。
OpenEye应用案例三: 基于ROCS和EON发现靶向STAT3 DNA的小分子抑制剂
信号转导及转录激活因子3(STAT3)参与慢性炎症、氧化应激等生物学效应,还参与细胞的凋亡及增殖、组织的修复和再生等,也可以抵抗压力负荷,并普遍存在于任何动物体内。STAT3容易被酪氨酸(Tyr705)激活并被细胞表面的酪氨酸激酶磷酸化,随后发生二聚化,核转位,并与基因DNA中特定位置结合,激活转录活性。在正常细胞中,STAT3信号通路的激活是受到严格控制的。在异常细胞中,通过上调其下游基因bcl-2、细胞周期蛋白D1和血管内皮生长因子(VEGF)等等来激活STAT3信号通路,从而诱导细胞增殖并阻止癌细胞的凋亡。临床研究发现,磷酸化STAT3(pSTAT3)大量存在于卵巢癌,结肠直肠癌,胃癌,胰腺癌,肾癌和宫颈癌的患者体内。
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