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CLC案例六——使用CLC进行HPV病毒基因组进化和发病机制研究
CLC案例六——使用CLC进行HPV病毒基因组进化和发病机制研究
2021年8月份发表在Pathogens杂志的一篇文章，采用CLC进行了HPV病毒基因组进化和发病机制研究。
CLC案例五——儿童痰液中微生物群落分析
CLC案例五——儿童痰液中微生物群落分析
采用CLC进行儿童痰液中微生物群落分析，比较了采用CLC 和 EBI Metagenomics工具的分析结果，表明CLC Bio MGM模块可以将所有的样本中菌群分类到门的水平；而EBI工具在15%的样本中都不能分配到门的水平。
CLC案例四——宏基因组学发展路上的有力帮手
CLC案例四——宏基因组学发展路上的有力帮手
鸟枪宏基因组学能够比较全面的进行微生物的分型和病原体的鉴定。但是，在实际操作的过程中，还有非常多的因素影响鉴定的准确性。本文探讨了鸟枪法宏基因组分析用到的工具，其中CLC Genomics Workbench在后期生信分析中能提供更为准确的结果。
CLC案例三——三种牛基因组对比分析
CLC案例三——三种牛基因组对比分析
鉴别瘤牛特有的外显子组变异，这些变异不存在野牛与牛的基因组中（Cosart et al. 2011）。此外，我们使用CLC Genomics Workbench内置工具gene ontology，试图将瘤牛特有的序列变异与改变的通路联系起来。
CLC案例二——使用CLC Genomics Workbench对比分析Toxascaris leonina与Toxocara canis功能基因注释
CLC案例二——使用CLC Genomics Workbench对比分析Toxascaris leonina与Toxocara canis功能基因注释
Toxocara canis（T.canis，狮弓蛔虫）和Toxascaris leonina（T.leonina，犬弓蛔虫）可能是最常见的狗胃肠蛔虫，两者具有相似之处，都属于蛔虫科，形态特征相似，非专业人员肉眼无法区分。然而，它们也表现出不同的生物学特征。目前已有多篇遗传变异研究报道了两种蛔虫的生物学、发病机理与鉴别诊断的特征，但尚未有人对两者的功能基因注释谱进行比较研究。
CLC案例一——使用来自Illumina与454测序平台的南非鲍转录组数据，评估De novo组装技术
CLC案例一——使用来自Illumina与454测序平台的南非鲍转录组数据，评估De novo组装技术
南非鲍（Haliotis midae）是一种腹足纲软体动物，分布地域广，从西海岸（萨尔达尼亚，Saldahna）到东海岸里特点（Riet Point），因此南非鲍生存环境的多样性导致了它遗传和基因表达的多样性，这是南非鲍能够在动态环境中生存的原因。
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