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OpenEye应用案例二十二：肌醇-1-磷酸合酶新型抑制剂的发现
OpenEye应用案例二十二：肌醇-1-磷酸合酶新型抑制剂的发现
肌醇-1-磷酸(MIP)合酶是肌醇生物合成途径中的关键酶。该酶以NAD依赖的方式将葡萄糖6-磷酸转化为1-肌醇-3-磷酸，这是产生包括磷脂在内的所有肌醇类化合物的第一步。MIP合酶是合成所有含肌醇化合物的限速酶。该酶与肌醇信号通路的中断，双向情感障碍有关。
OpenEye应用案例二十一：基于配体和受体虚拟筛选方法研究化合物靶标
OpenEye应用案例二十一：基于配体和受体虚拟筛选方法研究化合物靶标
当在研究中药化合物成分的作用机理或已知药物产生的副作用机制，以及确定新化合物的药物作用时，若遇到毫无头绪无从下手的情况，不妨试试发现化合物的可能作用靶标，来解决这一科研难题。以往我们都是通过反向找靶平台，来预测新化合物的作用靶点。常用的靶点预测平台有：PharmMapper（基于化合物三维结构、药效团匹配来确定靶标）、DRAR-CPI（基于DOCK算法来确定靶标）、TargetHunter（基于化合物二维结构来确定靶标）、idTarget（基于特殊的对接算法来确定靶标）等等。本次案例给大家介绍一种新的确定化合物靶点的方法。
OpenEye应用案例二十：从天然产物中发现抗疟疾化合物
OpenEye应用案例二十：从天然产物中发现抗疟疾化合物
天然产物一直是药物研发中的重要来源。在过去的二十几年中，超过1/3的FDA批准上市药物为天然产物及其衍生物。相比于化学合成分子，天然产物具有一些独特的性质，比如结构复杂度更高，骨架更加新颖，类药性更好等。因此，天然产物是一个值得关注的宝库，对于药物获得有巨大潜力。 天然产物是发现药物或药物先导结构的重要来源，抗疟药物奎宁和青蒿素的发现及临床应用就是最成功的例子。本次案例分享就给大家介绍一个从天然产物中发现抗疟疾药物的研究。
OpenEye应用案例十九：铜绿假单胞菌的琥珀酸脱氢酶抑制剂的发现
OpenEye应用案例十九：铜绿假单胞菌的琥珀酸脱氢酶抑制剂的发现
琥珀酸脱氢酶抑制剂已经广泛用于杀菌剂、抗生素的研究中。本研究旨在使用一系列计算和实验的方法来验证化合物Promysalin的作用靶标。
OpenEye应用案例十八：新型锥虫病抑制剂苯甲酰基异喹啉的发现研究
OpenEye应用案例十八：新型锥虫病抑制剂苯甲酰基异喹啉的发现研究
锥虫病是由克氏锥虫引起的一种热带寄生虫病，多见于美洲偏远地区。该病多由锥虫传播，在疫区发病率较高。部分病人急性期临床出现心肌炎、脑炎等，慢性期可累及心脏、消化道和外周神经。不经治疗本病可持续终身，严重影响生活质量。因此锥虫病已成为美洲地区严重的公共卫生问题。由于人口迁移、输血及器官移植的开展，加速了本病向世界范围扩散，所以引起了研究者们的关注。
OpenEye应用案例十七：用于治疗XLP-1 综合征的新型DGK抑制剂的发现
OpenEye应用案例十七：用于治疗XLP-1 综合征的新型DGK抑制剂的发现
二酰甘油（DAG）在二酰甘油激酶α（DGKa）催化下，发生磷酸化反应，生成磷脂酸（PA）。这两种分子是人体中的第二信使，调节许多生理过程：细胞增殖和运动、免疫反应、葡萄糖代谢和心血管反应等。二酰甘油激酶家族能有效的控制二酰甘油和磷脂酸在细胞中的浓度，并且该酶上调或下调会引发癌症、癫痫、帕金森等疾病。二酰甘油激酶家族有十种亚型，其中α亚型是研究最多的。二酰甘油激酶α在中枢神经系统、脾脏、胸腺、T细胞、肺等组织中都有表达，研究发现该酶是抗癌药物发现的重要靶标。研究还发现二酰甘油激酶α在肝癌细胞、黑色瘤细胞中过量表达，其抑制剂可以有效地杀死癌细胞、增强免疫细胞T细胞的活性。
OpenEye应用案例十六：基于结构虚拟筛选方法发现哈氏弧菌的AI-2群体感应系统抑制剂
OpenEye应用案例十六：基于结构虚拟筛选方法发现哈氏弧菌的AI-2群体感应系统抑制剂
本研究使用对接虚拟筛选方法发现AI-2群体感应系统抑制剂，希望发现新型治疗生物膜感染的化合物。
OpenEye应用案例十五：基于虚拟筛选方法发现新型抗炎药
OpenEye应用案例十五：基于虚拟筛选方法发现新型抗炎药
人口老龄化导致关节炎患者不断增加，其中骨关节炎（OA）和类风湿性关节炎（RA）是最常见的关节炎。而环氧化酶2（COX2）与关节炎的疼痛和炎症有关，其抑制剂可以有效的缓解疼痛。目前市场上出现的COX2抑制剂都为非甾体抗炎药（NSAID），这一类化合物存在着严重的副作用，长期使用会引起胃肠道不适、心肌梗塞等风险。因此新型COX2抑制剂的研究就变得非常重要。
OpenEye应用案例十四：新型流感病毒血凝素抑制剂的发现
OpenEye应用案例十四：新型流感病毒血凝素抑制剂的发现
本次案例分享给大家介绍一个甲型流感病毒抑制剂的发现过程。甲型流感病毒对人类健康产生着巨大的危害，病毒表面的两种蛋白（血凝素、神经氨酸酶）导致其有多种亚型，易发生变异。因此，寻求新型抗流感药物就变得十分迫切。
OpenEye应用案例十三：基于结构虚拟筛选发现新型TLR2抑制剂
OpenEye应用案例十三：基于结构虚拟筛选发现新型TLR2抑制剂
Toll样受体2（TLR2）作为细胞表面TLR家族的主要成员，在多种免疫细胞（如树状突细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、T细胞和B细胞等）中均有表达，在抗感染性疾病中发挥着重要作用。TLR2通过识别和结合广泛的微生物成分如脂肽、脂膜酸等，激活先天免疫系统。TLR2还在多种非感染性疾病中发挥着重要作用，如哮喘、肾病、动脉粥样硬化等。
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