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OpenEye应用案例三十二：IKK-2抑制剂的发现研究
OpenEye应用案例三十二：IKK-2抑制剂的发现研究
本研究旨在发现一些抑制IKK-2蛋白的化合物，并用于炎症疾病的治疗。
OpenEye应用案例三十一：从天然产物中发现新型PPARγ抑制剂
OpenEye应用案例三十一：从天然产物中发现新型PPARγ抑制剂
研究发现，PPARγ及其翻译后的磷酸化修饰与动脉粥样硬化、糖尿病、肿瘤等疾病密切相关。因此选择PPARγ靶蛋白为研究对象，进行新型抑制剂的发现和作用机理的研究。
OpenEye应用案例三十：存储调控钙离子内流（SOCE）通路抑制剂研究
OpenEye应用案例三十：存储调控钙离子内流（SOCE）通路抑制剂研究
钙离子是细胞中非常重要的第二信使。钙信号转导在生物体的整个生命进程中发挥着至关重要的作用。内质网钙库调控的胞外钙离子内流进程(SOCE)是哺乳动物中胞外钙离子内流的主要途径之一。SOCE过程起始于细胞外配体与细胞外膜上的受体结合，引发内质网中储存的钙离子释放。异常的SOCE通路会引发过敏、炎症和癌症等疾病。因此，SOCE通路的抑制剂可能对正常细胞的生物学功能产生较大影响。
OpenEye应用案例二十九：计算机辅助药物设计方法优化维生素K还原酶抑制剂
OpenEye应用案例二十九：计算机辅助药物设计方法优化维生素K还原酶抑制剂
华法林是世界范围内香豆素类提取物中常用的口服抗凝药，它主要通过抑制维生素K还原酶起作用的。维生素K还原酶是由VKORC1基因编码的，能还原维生素K环氧化物，当这个过程被抑制以后导致凝血因子Ⅱ、Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ含量降低从而达到抗凝血的作用。但是由于华法林的服用剂量与效果不一致，从而导致在长期应用时比其他药物更需要加强实验监测。因此，研究使用形状相似性、静电相似性和对接相互作用分析的方法来优化华法林的结构，期望发现新型的抑制维生素K还原酶的先导化合物。
OpenEye应用案例二十八：新型NAADP探针分子的发现
OpenEye应用案例二十八：新型NAADP探针分子的发现
由于缺少化学探针，所以阻碍了烟酸腺嘌呤二核苷酸磷酸（NAADP）的生物学作用的研究。NAADP存在于无脊柱动物海胆卵和哺乳动物的肌肉、神经、腺体等组织细胞中，是迄今为止已知最强的释放 Ca2+信使的分子。为了寻找新的化学探针来研究NAADP信号，研究选择基于配体的虚拟筛选方法——形状相似性筛选、静电相似性筛选来发现新型探针分子。
OpenEye应用案例二十七：基于形状相似性筛选发现组胺H1受体抑制剂
OpenEye应用案例二十七：基于形状相似性筛选发现组胺H1受体抑制剂
随着药物开发成本的不断增加和新批准药物的不断减少，为已有药物寻找新用途就变得非常重要。这一过程和新药研发相比，有较多优势。目前许多药物设计方法已被广泛的应用于“老药新用，一药多用”的研究中。
OpenEye应用案例二十六：新型单胺氧化酶B抑制剂的发现
OpenEye应用案例二十六：新型单胺氧化酶B抑制剂的发现
本研究靶向MAO-B蛋白，使用基于形状相似性筛选方法发现结构新颖的、选择性抑制MAO-B的化合物。
OpenEye应用案例二十五：虚拟筛选发现新型登革热病毒NS-3解旋酶抑制剂
OpenEye应用案例二十五：虚拟筛选发现新型登革热病毒NS-3解旋酶抑制剂
登革热病毒是一种能引起人类登革热、出血性登革热和登革休克综合征的黄病毒，其在世界范围内已造成了很大的危害，引起了全球的担忧和恐慌。登革热病毒非结构蛋白NS-3是一种多功能蛋白，其N端具有Ser蛋白酶活性，C端具有核苷三磷酸酶及RNA解旋酶的活性，在病毒RNA的复制和病毒前体的加工过程中发挥着重要的作用。因此NS-3蛋白已经成为抗病毒药物研制的重要靶标。本研究基于配体和受体虚拟筛选方法来快速发现新型NS-3解旋酶抑制剂，为登革热的治疗提供新方法。
OpenEye应用案例二十四：基于配体相似性筛选发现新型FabI抑制剂
OpenEye应用案例二十四：基于配体相似性筛选发现新型FabI抑制剂
土拉弗菌F. tularensis是兔热病的致病菌。目前治疗该细菌感染的药物有：链霉素和庆大霉素为主的氨基糖苷类药物、四环素和氯霉素。然而，氨基糖苷类药物需要静脉注射，儿童和孕妇使用四环素具有禁忌症，氯霉素具有骨髓毒性。因此开发出新型的安全高效的口服抗生素，用于治疗土拉弗菌感染十分必要。
OpenEye应用案例二十三：新型G9a抑制剂的发现
OpenEye应用案例二十三：新型G9a抑制剂的发现
组蛋白甲基转移酶异常表达会导致组蛋白甲基化模式失衡并促进人类癌症的发生发展。G9a（也被称作KMT1C）是第二个被报道的组蛋白甲基转移酶。研究发现，在人类多种器官来源的肿瘤细胞中均有G9a表达的上调，而抑制G9a则可抑制肿瘤的生长和转移。
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